“我們采用NgAgo技術(shù),并不是要進行重復(fù)或驗證,僅僅是把它當(dāng)作一種工具,建立基因敲除斑馬魚模型。”
11月13日,記者聯(lián)系到南通大學(xué)神經(jīng)再生重點實驗室副教授劉東,他電話另一端強調(diào)著這句話。
在11日出版的新一期《自然》雜志子刊《細(xì)胞研究》上,劉東以通訊作者身份發(fā)表論文,報告了將NgAgo基因技術(shù)用于斑馬魚的研究結(jié)果。當(dāng)天晚上,消息就傳遍國內(nèi)各大學(xué)術(shù)圈。“第二天早上起來一看,我的手機都快被各種消息擠爆了。”
一篇論文為何引起這么大的反響?圈內(nèi)人士告訴記者,雖然是發(fā)表在《自然》雜志子刊上,但這樣的轟動效應(yīng)還是從來沒有過的,原因只有一個,劉東采用了廣受學(xué)術(shù)界質(zhì)疑的NgAgo基因技術(shù)。這是自韓春雨之后,中國研究人員發(fā)表的有關(guān)NgAgo基因技術(shù)的第二篇學(xué)術(shù)論文。
今年5月,河北科技大學(xué)韓春雨團隊在《自然》雜志子刊《自然·生物技術(shù)》上首次發(fā)表關(guān)于NgAgo基因技術(shù)的論文,全球為之轟動。但隨后,多名國內(nèi)外學(xué)者公開表示無法重復(fù)論文中描述的實驗,從而引發(fā)爭議。
“各路媒體,甚至還有許多國外雜志找到我,讓我發(fā)表對韓春雨和NgAgo技術(shù)的評價,這真是讓我們很苦惱的問題。”劉東說,客觀地來看,從學(xué)術(shù)角度確實無法評價,“我們用不同的系統(tǒng),也沒有重復(fù)他的實驗,僅僅是都用了NgAgo這樣一個蛋白質(zhì)而已,無法做任何關(guān)聯(lián)和討論”。
劉東告訴科技日報記者,他主要從事的是血管新生方面的研究,“利用多種遺傳操作技術(shù)建立轉(zhuǎn)基因和基因敲除斑馬魚模型”在實驗室主頁關(guān)于他本人的研究領(lǐng)域介紹中排第三,也就是說,這只是他的一項“副業(yè)”——利用這些模型來研究血管新生。
在此次發(fā)表的論文中,劉東敲低的基因是fabp11a,并因此導(dǎo)致斑馬魚眼部發(fā)育缺陷。“這與血管新生沒有直接的聯(lián)系。”他直截了當(dāng)?shù)馗嬖V記者。
但是在實驗之初,劉東確實是想利用NgAgo技術(shù)進行基因敲除,而不是敲低。敲除和敲低盡管只有一字之差,但卻是完全不同的兩個學(xué)術(shù)概念。
基因敲除是去除不想要的基因,使目標(biāo)基因永久性地表達沉默;而基因敲低則保留目標(biāo)基因,只是阻斷目標(biāo)基因的表達,但在下一代生物體內(nèi)依然能夠進行基因表達。敲除是基因編輯的功能之一,而敲低不是。
在5月開始的實驗中,劉東想要完成的基因敲除沒有實現(xiàn),但是卻意外收獲基因敲低這一結(jié)果。為了確保實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性,整個實驗持續(xù)了5個多月,直到投稿時實驗仍然在持續(xù)。
他們發(fā)現(xiàn),NgAgo的存在,使30%的斑馬魚胚胎在發(fā)育后出現(xiàn)了眼部畸形,但這不是基因編輯的結(jié)果。測序發(fā)現(xiàn),fabp11a的基因沒有發(fā)生任何變化,反倒是fabp11a mRNA的相對表達量下降了約50%。fabp11a沒有被編輯,但被敲低了。
NgAgo對fabp11a mRNA表達的下調(diào)只是一個意外嗎?為了驗證這一點,研究人員又對斑馬魚中的其它4個基因進行了測試。結(jié)果發(fā)現(xiàn),NgAgo都能實現(xiàn)敲低作用。因此,他們得出結(jié)論:NgAgo的敲低作用是具有普遍性的。
“從實驗中看,NgAgo的基因敲低效率(比傳統(tǒng)方法)更高。”劉東說,不過他也補充說,這一觀點并不是很嚴(yán)謹(jǐn),畢竟測試的基因數(shù)量很少,方法也不是很系統(tǒng)。
盡管如此,劉東還是很肯定地表示,沒有在NgAgo中重復(fù)出基因編輯功能。“我們認(rèn)為gDNA/NgAgo為斑馬魚中的基因敲低提供了一種替代方案。”在論文中,劉東和他的伙伴們這樣寫道。
對于未來會不會繼續(xù)在實驗中研究觀察NgAgo技術(shù),劉東說:“這不是我的主要研究方向和興趣,是否進一步研究還不確定。”(科技日報南京11月13日電)
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