課題組簡介
阮玨課題組,主要研究領(lǐng)域?yàn)楦咄繙y序技術(shù)下的生物信息學(xué)算法研發(fā)和應(yīng)用。團(tuán)隊(duì)研究方向主要包括全基因組組裝算法、極低頻點(diǎn)突變檢測、基因組結(jié)構(gòu)變異檢測、DNA存儲(chǔ)技術(shù)、以及基因組分析技術(shù)開發(fā)。1)研發(fā)計(jì)算效率極高的三代長序列組裝算法,以降低大型復(fù)雜基因組組裝對(duì)計(jì)算資源的巨大需求;2)為提高結(jié)構(gòu)變異的檢測準(zhǔn)確性和敏感性,開發(fā)高效算法;3)為針對(duì)性提高基因組極低頻突變測序的檢測效率與數(shù)據(jù)利用率,開發(fā)新型高效測序檢測技術(shù);4)實(shí)現(xiàn)產(chǎn)學(xué)研結(jié)合,將基因組學(xué)技術(shù)應(yīng)用到科研項(xiàng)目,輔助解決重大科研問題。
課題組長阮玨,研究員,博士生導(dǎo)師,組學(xué)技術(shù)研究中心主任,國家優(yōu)秀青年基金獲得者,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院“農(nóng)科英才”,農(nóng)業(yè)農(nóng)村部“杰出青年農(nóng)業(yè)科學(xué)家”;主要研究領(lǐng)域?yàn)榛蚪M序列比對(duì)與序列組裝,參與開發(fā)MAQ、SAMTools、SOAPdenovo、Pseudo-sanger、Rainbow、Novobreak、SAMRTdenovo、WTDBG等算法軟件,還設(shè)計(jì)開發(fā)了Droplet-CirSeq、EasyMF、O2N-Seq等測序方法。學(xué)術(shù)論文發(fā)表在Nature、Nature Methods、Nature Genetics、Genome Research、Nature Communications、Bioinformatics等期刊,累計(jì)他引超過14,000次。(http://www.agis.org.cn/rcpy/nkyrc/zgnykxynkyctszcljrcrxzalblcl/230318.htm)
項(xiàng)目簡介
“國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃--新型生物納米孔測序技術(shù)的研發(fā)及測序儀的研制”針對(duì)新型納米孔測序電信號(hào)的特點(diǎn),引入序列組成結(jié)構(gòu)對(duì)堿基過孔速度影響的先驗(yàn)?zāi)P,泛?ldquo;分割+預(yù)測”的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),擴(kuò)展識(shí)別堿基的字符空間,設(shè)計(jì)出高效準(zhǔn)確的解碼算法,將新型納米孔測序儀產(chǎn)出的電信號(hào)解碼為終端用戶可用的堿基序列。
深圳市基礎(chǔ)研究機(jī)構(gòu)“多組學(xué)算法研發(fā)”任務(wù),以“從基因組學(xué)到表型組學(xué)”為核心設(shè)計(jì)思路,在強(qiáng)化基因組學(xué)算法的基礎(chǔ)上,突破組學(xué)核心算法技術(shù)。創(chuàng)新復(fù)雜基因組分析技術(shù),突破超大基因組和多倍體基因組的拼接算法,開發(fā)基于圖論的結(jié)構(gòu)變異檢測算法、多組學(xué)數(shù)據(jù)基因注釋整合算法,輕設(shè)施表型組圖像識(shí)別算法等一系列組學(xué)算法技術(shù),初步建成國際農(nóng)業(yè)組學(xué)算法研發(fā)中心。
一、招聘需求
現(xiàn)針對(duì)以上兩項(xiàng)任務(wù),面向社會(huì)公開招聘1.序列分析算法研發(fā)、2.深度學(xué)習(xí)算法開發(fā)、3.測序?qū)嶒?yàn)方法研發(fā),等方向的研究人員3~5名,共同參與項(xiàng)目開發(fā),具體招聘條件如下:
二、崗位要求
1.本科(含)以上學(xué)歷;
2.身體健康,年齡在35周歲以下;
3.熟悉掌握分析算法研發(fā),深度學(xué)習(xí)編程,測序?qū)嶒?yàn)研發(fā)等技術(shù)之一;
4.滿足以下條件的研究人員優(yōu)先:
1)知名算法軟件或?qū)嶒?yàn)技術(shù)主要開發(fā)者;
2)有基因組學(xué)/生物信息學(xué)背景(或經(jīng)驗(yàn))者;
3)有深度學(xué)習(xí)背景(或經(jīng)驗(yàn))者;
4)程序設(shè)計(jì)大賽獲獎(jiǎng)?wù)撸?/span>
5)獨(dú)立開發(fā)較大規(guī)模程序代碼者。
1.稅前月薪8000~25000元,根據(jù)能力和經(jīng)驗(yàn)面議;
2.相關(guān)社會(huì)保險(xiǎn)公積金及其他符合人才政策的待遇按照深圳市有關(guān)規(guī)定執(zhí)行;
3.其他:
1)鼓勵(lì)以一作或通訊作者發(fā)表學(xué)術(shù)論文;
2)提供科研晉升通道;
四、應(yīng)聘方式
請(qǐng)將個(gè)人簡歷以電子郵件形式發(fā)送到:ruanjue@caas.cn,郵件主題為“應(yīng)聘+姓名 ”,個(gè)人簡歷應(yīng)包含教育背景、工作經(jīng)歷、研究成果等。應(yīng)聘材料請(qǐng)壓縮成一個(gè)zip文件以附件發(fā)送。所有應(yīng)聘材料我們會(huì)仔細(xì)分析并保密,一旦候選人確定后,將邀請(qǐng)您進(jìn)行面試。
五、聯(lián)系方式
阮玨:ruanjue@caas.cn、謝欣:xiexin01@caas.cn
為防止簡歷投遞丟失請(qǐng)抄送一份至:boshijob@126.com(郵件標(biāo)題格式:應(yīng)聘職位名稱+姓名+學(xué)歷+專業(yè)+中國博士人才網(wǎng))
中國-博士人才網(wǎng)發(fā)布
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