基因組所介紹
中國農(nóng)業(yè)科學院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所（簡稱“基因組所”），是中國農(nóng)業(yè)科學院和深圳市共同舉辦的新型國家級研究所。成立四年來，踐行“躍居世界農(nóng)業(yè)科技高端，服務產(chǎn)業(yè)重大科技需求”國家使命，服務于粵港澳大灣區(qū)戰(zhàn)略部署和深圳市國際科技產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新中心建設，打造了國際領先的“種質(zhì)資源收集—基因組測序和分析—功能基因挖掘—分子設計育種”的全鏈條創(chuàng)新平臺；引進了40余位具有國際競爭力的PI，累計招收博士后130多名；在農(nóng)業(yè)生物組學基礎、基因組學與動植物分子育種、基因組學與動植物健康等方向取得了突出成果，在Science、Nature、Cell、NatureGenetics等知名期刊上發(fā)表SCI論文300余篇，奠定了我國農(nóng)業(yè)基因組學的國際地位。
程時鋒課題組簡介
中國農(nóng)業(yè)科學院（深圳）農(nóng)業(yè)基因組研究所（簡稱“基因組所”）合成生物學研究中心程時鋒團隊致力于植物比較進化基因組學、作物群體遺傳學、和關鍵性狀起源和演化機制的多組學ENCODE研究。
近年來重點關注trait-based的Phylo-GWAS研究方法、大規(guī)模比較進化基因組學、作物群體大數(shù)據(jù)gene-trait關聯(lián)和連鎖研究方法，如開發(fā)多倍體作物（小麥、燕麥等）群體多樣性繪制(包括Pan-genome、Pan-SV和Pan-NLRome)和及高效的GWAS關聯(lián)分析基因發(fā)現(xiàn)工具和算法，包括開發(fā)kmer-basedGWAS,PAV/SV-GWAS,eGWAS,mGWAS等。
主要項目包括：（1）“谷-豆”國際基因組聯(lián)盟計劃（http://www.g3rp.com/）下的禾本科作物和豆科豆類比較基因組和群體基因組；（2）結(jié)瘤生物固氮分支N-fixingRootNoduleSymbiosis祖先新性狀起源與多樣性演化的基因表達表觀調(diào)控機制；（3）C4高光合大規(guī)模比較進化基因組學，及其起源和平行演化的基因表達表觀調(diào)控機制。團隊先后參與完成了多個重大項目，相關研究結(jié)果發(fā)表在Cell、Science、NatureGenetics、NatureBiotechnology、Gigascience、PlantCell、PlantJournal等知名國際期刊上。目前擁有團隊成員15名，主要來自計算機科學、基因組學、生物信息學、植物分子生物學、進化與群體遺傳學等多個學科。
01招聘需求
1.生物信息學算法開發(fā)博士后1名。
2.生物信息學算法開發(fā)工程師1名。
3.植物進化基因組、多組學和群體遺傳信息大數(shù)據(jù)分析博士后1名。
4.田間育種專員1名。
02崗位職責
生信及算法/工具開發(fā)：
1.基因組功能元件、序列模型預測深度學習算法、流程開發(fā)。
2.植物大規(guī)模系統(tǒng)比較進化基因組學方法構(gòu)建。
3.開發(fā)群體遺傳學單倍型多樣性挖掘及基因發(fā)現(xiàn)新方法。
4.利用深度學習等算法整合基因大數(shù)據(jù)，開發(fā)表征量化可視化方法，開發(fā)數(shù)據(jù)庫，建設網(wǎng)站在線分析工具。
田間育種專員：
1.作物田間實驗設計、規(guī)劃和管理。
2.作物表型鑒定、組織/核酸/材料提取等樣本文庫制備。
03應聘條件
博士后：
1.博士學位，數(shù)學、計算機科學、數(shù)理統(tǒng)計、生物信息學、物理學、基因組學等相關專業(yè)；熟練使用Linux系統(tǒng)，至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種。
2.勤于思考，能獨立開展課題研究，學術態(tài)度嚴謹，善于團隊合作。
3.良好的溝通能力和中英文科技寫作能力。
4.不超過35周歲，近3年在國際學術刊物以第一作者發(fā)表過或即將發(fā)表SCI論文。
生信算法開發(fā)工程師：
1.985/211本科畢業(yè)，生物信息學或計算機專業(yè)。
2.熟練使用Linux系統(tǒng)，至少熟練掌握Perl、Python、R、C/C++、JAVA等語言中的兩種。
3.有相關工作經(jīng)驗者優(yōu)先。
田間育種專員：
1.碩士及以上學歷，育種相關專業(yè)，具有作物（小麥優(yōu)先）育種相關的理論知識。
2.1年以上從事作物育種的工作經(jīng)驗，如作物品種的選育。
3.具有一定的計算機運用能力，能獨立完成數(shù)據(jù)收集、錄入和分析。
4.工作認真，有責任感，執(zhí)行力強，工作效率高；良好的溝通能力和團隊協(xié)作能力。
5.英語寫作和口語優(yōu)秀者，優(yōu)先考慮。
04崗位待遇
博士后：
1.在站期間享受深圳市和大鵬新區(qū)的在站博士后生活補貼，共計稅后60萬元。
2.按照研究所的相關規(guī)定提供博士后的工資、五險一金和績效待遇。
3.博士后人員進站后，可選擇落戶深圳市，其配偶及未成年子女可辦理隨遷入戶，并且享受深圳市和大鵬新區(qū)的新引進人才生活補貼，共計稅后6萬元。
4.博士后在站期間鼓勵申報中國博士后基金、國家自然科學青年基金，項目結(jié)題且出站后留深工作的可認定為深圳市后備級高層次人才，獎勵160萬，若在大鵬新區(qū)工作，另有1:1配套補貼。
生信算法開發(fā)工程師、田間育種專員：
1.薪資待遇面議，相關社會保險及公積金按照深圳市有關規(guī)定執(zhí)行。
05申請方式
申請者請將個人簡歷（包含教育經(jīng)歷、研究經(jīng)歷、論文發(fā)表）、代表作和研究意向以電子郵件形式發(fā)送至：chengshifeng@caas.cn，郵件主題和材料壓縮文件請注明“姓名+申請職位名稱 ”。
研究所會仔細分析并保密所有申請資料，并在收到申請的一個月內(nèi)與初審合格者電話或E-mail聯(lián)系，安排面試；資格審查未通過者，不再另行告知。
程時鋒代表論文
1. Cheng S*, Xian W, Fu Y, et al. Genomes of SubaerialZygnematophyceae Provide Insights into Land Plant Evolution. Cell, 2019,179(5): 1057-1067. e14.
2. Griesmann M, Chang Y, Liu X, et al. Cheng S†. Phylogenomicsreveals multiple losses of nitrogen-fixing root nodule symbiosis[J]. Science,2018, 361(6398): eaat1743.
3. Cheng S*, Melkonian M, Smith SA, et al. 10KP: Aphylodiverse genome sequencing plan. Gigascience. 2018;7(3):1–9.
4. Cheng S*, Gutmann B, Zhong X, et al. Redefining thestructural motifs that determine RNA binding and RNA editing bypentatricopeptide repeat proteins in land plants. Plant J.2016;85(4):532–547.
5. Lin S, Cheng S*, Song B, et al. The Symbiodiniumkawagutii genome illuminates dinoflagellate gene expression and coral symbiosis. Science.2015;350(6261):691–694.
6.Cheng S*, van den Bergh E, Zeng P, et al. TheTarenaya hassleriana genome provides insight into reproductive trait and genomeevolution of crucifers. Plant Cell. 2013;25(8):2813–2830.
7. Zhang, G., Liu, X., Quan, Z. Cheng S*. et al. Genomesequence of foxtail millet (Setaria italica) provides insights into grassevolution and biofuel potential. Nat Biotechnol 30, 549–554 (2012).
來源：
http://www.agis.org.cn/xwzx/tzgg/273999.htm
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